Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chsy1Q6ZQ11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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