Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnt1Q6ZPR4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnt1Q6ZPR4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms