Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxb3Q6XAS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxb3Q6XAS4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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