Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssx9Q6XAS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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