Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8b3Q6UQ17 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp8b3Q6UQ17 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8b3Q6UQ17 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp8b3Q6UQ17 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms