Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt9Q6RHW0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt9Q6RHW0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms