Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d2Q6PHS9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d2Q6PHS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms