Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx13Q6PHS6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms