Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85bQ6PDY0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85bQ6PDY0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85bQ6PDY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms