Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2lQ6PDS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms