Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc2Q6PDG5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc2Q6PDG5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc2Q6PDG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc2Q6PDG5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms