Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc117Q6PB51 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc117Q6PB51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms