Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BC061212Q6P8K3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BC061212Q6P8K3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms