Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc148Q6P5U8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc148Q6P5U8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms