Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sik3Q6P4S6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sik3Q6P4S6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sik3Q6P4S6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms