Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Podnl1Q6P3Y9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Podnl1Q6P3Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podnl1Q6P3Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podnl1Q6P3Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms