Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casc4Q6P2L7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casc4Q6P2L7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms