Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm2bQ6P1G2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2bQ6P1G2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm2bQ6P1G2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms