Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23ipQ6NZC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23ipQ6NZC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms