Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rprd2Q6NXI6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rprd2Q6NXI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rprd2Q6NXI6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms