Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc66Q6NS45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc66Q6NS45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms