Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NipblQ6KCD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NipblQ6KCD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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