Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CltbQ6IRU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms