Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm4Q6IRU2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm4Q6IRU2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms