Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt42Q6IFX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt42Q6IFX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt42Q6IFX2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt42Q6IFX2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms