Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KdsrQ6GV12 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms