Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep290Q6A078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep290Q6A078 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep290Q6A078 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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