Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdzrn3Q69ZS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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