Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrcc1Q69ZB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrcc1Q69ZB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms