Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sbno1Q689Z5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Sbno1Q689Z5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sbno1Q689Z5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sbno1Q689Z5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms