Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CilpQ66K08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms