Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q66JV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q66JV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q66JV7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q66JV7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q66JV7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q66JV7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q66JV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q66JV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q66JV7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q66JV7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q66JV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q66JV7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q66JV7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q66JV7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q66JV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q66JV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q66JV7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q66JV7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q66JV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q66JV7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q66JV7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q66JV7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q66JV7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q66JV7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q66JV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q66JV7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q66JV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q66JV7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q66JV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q66JV7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q66JV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q66JV7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q66JV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q66JV7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q66JV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q66JV7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q66JV7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q66JV7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms