Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna3Q65CL1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnna3Q65CL1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms