Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprdQ64487 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprdQ64487 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms