Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2kQ63871 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms