Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic2Q62520 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms