Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps72Q62481 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps72Q62481 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps72Q62481 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms