Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcncQ62447 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcncQ62447 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcncQ62447 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CcncQ62447 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcncQ62447 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms