Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp1Q62442 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp1Q62442 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms