Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SypQ62277 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SypQ62277 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SypQ62277 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SypQ62277 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SypQ62277 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SypQ62277 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SypQ62277 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SypQ62277 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SypQ62277 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SypQ62277 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SypQ62277 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SypQ62277 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SypQ62277 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SypQ62277 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SypQ62277 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SypQ62277 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SypQ62277 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SypQ62277 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SypQ62277 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SypQ62277 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SypQ62277 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SypQ62277 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SypQ62277 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SypQ62277 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SypQ62277 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SypQ62277 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SypQ62277 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SypQ62277 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SypQ62277 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SypQ62277 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SypQ62277 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SypQ62277 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SypQ62277 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SypQ62277 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SypQ62277 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SypQ62277 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SypQ62277 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms