Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpcQ62241 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpcQ62241 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms