Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sycp1Q62209 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms