Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr4Q62186 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssr4Q62186 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr4Q62186 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms