Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp2Q61990 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcbp2Q61990 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp2Q61990 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcbp2Q61990 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcbp2Q61990 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcbp2Q61990 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pcbp2Q61990 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms