Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp90Q61967 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp90Q61967 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp90Q61967 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms