Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1aQ61495 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1aQ61495 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1aQ61495 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms