Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccna1Q61456 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms