Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcolceQ61398 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PcolceQ61398 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcolceQ61398 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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PcolceQ61398 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PcolceQ61398 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PcolceQ61398 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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