Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1eQ61290 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cacna1eQ61290 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms