Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcp1Q61233 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcp1Q61233 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcp1Q61233 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms